在此時阿克西斯的態度卻開始顯得曖昧不明起來。原本對於獵殺舊吉 翁自護殘黨的迪坦斯，阿克西斯該是全然地對立才是；但在復興 吉翁、培養實力的前提下，哈曼哈馬加和迪坦斯亦開始頻頻接觸 。這情形令幽谷漸漸感到不安，於是在２月２日發動了「梅爾胥特羅 姆作戰」，從阿克西斯手中奪回可羅尼雷射砲「格里布斯２」，以確 保戰力優勢。幽谷艦隊成功地達成了任務，阿克西斯的領導人哈曼卻 不肯善罷干休。她再次移動了阿克西斯，向著幽谷本部所在的月面都 市格拉那達墜下；但這次行動被幽谷以可羅尼雷射改變了阿克西斯的 墜落路線而告失敗。

２月２２日，由巴布迪瑪斯．西羅克統一的迪坦斯，和阿克西斯與幽 谷艦隊在格里布斯２附近的字宙空域各自集結了所屬戰力，展開了大 規模的三方面攻防戰。激烈的戰鬥在幽谷便用了格里布斯２的可羅尼 雷射砲，消滅了大半迪坦斯艦隊後結束；迪坦斯的領導人西羅克在MS 戰之中戰死，迪坦斯可說在實際上已經覆滅。但在戰鬥中損傷慘重的 幽谷也不是勝利者，新領導者夏亞馬沙在混戰中下落不明，優秀 的飛行員幾乎無一倖存。惟有阿克西斯漁翁得利；保留了大半戰力的 他們迅速成為了地球圈內的最大勢力。

４個月後，正式命名為「新．吉翁」(Neo Zeon)的阿克西斯對地球發動 了侵攻。幾乎完全沒有受到聯邦軍的抵抗，新吉翁的先遣部隊輕易地 在地面上建立了前進基地。一方面固然是因為元氣大傷的幽谷無力阻 止，一方面也是由於得到了一年戰爭中並未降服，自組為游擊隊的舊 吉翁殘黨的協助。在宇宙方面，判定幽谷已呈潰敗狀態的哈曼向各個 可羅尼派出了制壓部隊，掌握了制宙權。而事實上幽谷也沒有反擊的 作戰。同年８月１日新吉翁本隊降下地球的時侯，也只有阿卡馬亞 加瑪一艘戰艦出現而已。

８月２９日，哈曼無血佔領了聯邦議會的所在地，達喀爾市。雖然不 久後便在幽谷和卡拉巴的聯合攻擊下又撤出達喀爾，但這並未能阻止 哈曼的企圖。１０月３１日，新吉翁示威性地將一座可羅尼墜落到英 國愛爾蘭的都柏林市，以此為恐嚇。哈曼要求聯邦政府將Side 3（吉翁 共和國）讓渡給新吉翁。在聯邦政府滿足了她所提的條件之後，哈曼 於１１月１４日返回太空，進駐Side 3。

雖然新吉翁看似已控制了大局，暗地裡卻聚起另一波分裂的浪潮。自 稱擁有薩比家血統的卡雷米．托托背叛了哈曼，以人工受精的NewType 部隊為主力，佔領了阿克西斯上的「摩烏莎」，並以此為據點，正式 向聚集在Side 3中心區的可羅尼「核心３(Core 3)」的哈曼軍隊挑起 了戰火。００８９年１月１６日，卡雷米艦隊向核心３發動了攻擊。 幽谷只有一艘戰艦「類．阿卡馬擬．亞加瑪」（意為「很像阿卡 馬」）參戰，類．阿卡馬的MS部隊先行攻擊摩烏莎，在潛入其內部後 ，殺死了卡雷米。而後摩烏莎直直地撞上了核心３，兩方面的艦隊都 在衝撞中損毀，哈曼隨後在與幽谷的新型MS ZZ Gundam的戰鬥中死亡 。情勢由最後到達之重新編成的幽谷艦隊控制，結束了「第一次新吉 翁抗爭」。